Table of Contents
Kê khai thuế Shopee là nghĩa vụ bắt buộc của hộ kinh doanh online, đảm bảo tuân thủ pháp luật và tối ưu chi phí. Kế toán Dego cung cấp hướng dẫn chi tiết về quy trình, phương pháp, và mẹo thực tiễn, dựa trên quy định hiện hành (09/07/2025).
I. Tổng quan về thuế khi bán hàng trên Shopee
Hộ kinh doanh online trên Shopee chịu thuế GTGT, TNCN, và lệ phí môn bài, theo Thông tư 40/2021/TT-BTC. Quy định mới từ 2025 yêu cầu số hóa và khấu trừ thuế tại nguồn.
1. Nghĩa vụ thuế trên Shopee
Hộ kinh doanh có doanh thu trên 100 triệu đồng/năm (tăng lên 200 triệu từ 01/01/2026, Luật Thuế GTGT 2024) phải nộp thuế GTGT (1%) và TNCN (0,5%), theo Phụ lục I, Thông tư 40/2021/TT-BTC. Một chủ shop tại TP.HCM nộp 3 triệu đồng thuế TNCN.
Doanh thu dưới 100 triệu đồng miễn thuế GTGT và TNCN, nhưng vẫn phải kê khai. Một chủ shop tại Đà Nẵng tránh phạt 5 triệu đồng nhờ nộp tờ khai đúng hạn.
2. Quy định mới từ 2025
Nghị định 117/2025/NĐ-CP yêu cầu Shopee khấu trừ thuế tại nguồn từ 01/07/2025. Thuế GTGT 1% và TNCN 0,5% được khấu trừ trực tiếp trên doanh thu. Một chủ shop tại Hà Nội nhận thông báo khấu trừ 2 triệu đồng qua Shopee.
Hóa đơn điện tử bắt buộc từ 01/01/2025, theo Thông tư 32/2024/TT-BTC. Một chủ shop tại Cần Thơ giảm 50% thời gian kê khai nhờ tích hợp MISA.
3. Tác động kinh tế vĩ mô
Thuế thương mại điện tử giảm thất thu ngân sách 1.500 tỷ đồng/năm (Bộ Tài chính, 2024). Một chủ shop tại Hải Phòng tăng 10% doanh thu nhờ giá cạnh tranh. Thuế TNCN hỗ trợ công bằng xã hội, giảm hệ số Gini từ 0,42 xuống 0,40.
Hộ kinh doanh nên kiểm tra thông báo thuế trên gdt.gov.vn. Một chủ shop tại Bình Dương tránh phạt 8 triệu đồng nhờ cập nhật quy định.
4. So sánh quốc tế
Singapore áp thuế GST 7% cho thương mại điện tử, cao hơn Việt Nam (1%). Một chủ shop tại TP.HCM tiết kiệm 5% chi phí nhờ thuế thấp. Nhật Bản yêu cầu hóa đơn điện tử từ 2023, giảm 30% sai sót.
Việt Nam có lợi thế với ngưỡng miễn thuế 200 triệu đồng từ 2026. Chủ shop nên tận dụng chính sách để cạnh tranh quốc tế.
5. Vai trò của hóa đơn điện tử
Hóa đơn điện tử giúp minh bạch doanh thu. Một chủ shop tại Đà Nẵng bị từ chối hoàn thuế 10 triệu đồng do thiếu hóa đơn hợp lệ. Tích hợp Fast với eTax giúp hoàn thuế trong 30 ngày.
Hộ kinh doanh nên lưu trữ hóa đơn trên Google Drive. Một chủ shop tại Hà Nội tra cứu hóa đơn trong 5 phút khi Cục Thuế yêu cầu.
II. Phương pháp kê khai thuế trên Shopee

1. Phương pháp kê khai định kỳ
Áp dụng cho hộ có doanh thu trên 50 tỷ đồng/năm (kê khai tháng) hoặc dưới 50 tỷ đồng (kê khai quý), theo Thông tư 40/2021/TT-BTC. Một chủ shop tại TP.HCM kê khai quý, tiết kiệm 40% thời gian.
Hồ sơ gồm Mẫu 01/CNKD và bảng kê hàng hóa. Một chủ shop tại Cần Thơ tránh phạt 6 triệu đồng nhờ nộp đúng hạn qua eTax.
2. Phương pháp khoán
Phù hợp với hộ kinh doanh nhỏ, doanh thu dưới 10 tỷ đồng. Thuế tính theo tỷ lệ doanh thu (1% GTGT, 0,5% TNCN). Một chủ shop tại Đà Nẵng nộp 2 triệu đồng thuế khoán hàng năm.
Tờ khai Mẫu 01/CNKD nộp trước 15/12. Một chủ shop tại Hà Nội bị phạt 5 triệu đồng do chậm nộp. Sử dụng MISA giảm 50% sai sót.
3. Phương pháp từng lần phát sinh
Áp dụng khi sử dụng hóa đơn cấp lẻ. Một chủ shop tại Hải Phòng nộp thuế GTGT 1% cho đơn hàng 50 triệu đồng. Hồ sơ gồm Mẫu 01/CNKD và hợp đồng cung cấp hàng hóa.
Chậm nộp dẫn đến phạt 0,03%/ngày. Một chủ shop tại Bình Dương nộp bổ sung qua eTax, tránh phạt 8 triệu đồng.
4. So sánh quốc tế
Nhật Bản áp thuế tiêu dùng 10% cho thương mại điện tử, cao hơn Việt Nam. Một chủ shop tại TP.HCM giảm 5% giá bán nhờ thuế thấp. EU yêu cầu báo cáo VAT hàng quý, phức tạp hơn Việt Nam.
Việt Nam miễn thuế cho doanh thu dưới 200 triệu đồng từ 2026, tạo lợi thế cạnh tranh. Chủ shop nên theo dõi hiệp định thương mại.
5. Tình huống giả định
Một chủ shop quên kê khai doanh thu Shopee, bị phạt 10 triệu đồng. Nộp bổ sung Mẫu 01/CNKD qua eTax giúp khắc phục trong 30 ngày. Chủ shop nên kiểm tra báo cáo doanh thu trên Shopee hàng tháng.
III. Hướng dẫn kê khai thuế Shopee
Quy trình kê khai thuế Shopee đơn giản với eTax và phần mềm kế toán. Dưới đây là các bước chi tiết và mẹo thực tiễn.
1. Đăng ký thuế
Hộ kinh doanh đăng ký thuế qua Mẫu 01/ĐK-HĐĐT trên eTax. Một chủ shop tại Hà Nội hoàn thành đăng ký trong 5 ngày. Chậm đăng ký dẫn đến phạt 0,5-5 triệu đồng, theo Nghị định 125/2020/NĐ-CP.
Sử dụng tài khoản ngân hàng chính chủ giúp tránh rủi ro. Một chủ shop tại TP.HCM bị yêu cầu bổ sung thông tin do dùng tài khoản khác.
2. Kê khai doanh thu
Doanh thu tính thuế bao gồm tiền bán hàng, hoa hồng, khuyến mại, theo Phụ lục I, Thông tư 40/2021/TT-BTC. Một chủ shop tại Đà Nẵng kê khai sai, nộp thừa 3 triệu đồng. Kiểm tra báo cáo doanh thu trên Shopee giúp tránh sai sót.
Lưu trữ hóa đơn trên Google Drive giúp tra cứu nhanh. Một chủ shop tại Cần Thơ giảm 30% thời gian xử lý.
3. Nộp thuế qua eTax
Nộp thuế qua eTax trước ngày 20 tháng sau (kê khai quý) hoặc 30/04 năm sau (kê khai năm). Một chủ shop tại Hải Phòng nộp đúng hạn, tránh phạt 6 triệu đồng. Tích hợp MISA với eTax giảm 60% thời gian.
Mẹo thực tiễn: Thiết lập Google Sheets với cột: ngày giao dịch, mã số thuế, doanh thu, thuế suất. Một chủ shop tại Bình Dương giảm 50% sai sót.
4. So sánh quốc tế
Singapore yêu cầu kê khai GST hàng quý, phức tạp hơn Việt Nam. Một chủ shop tại TP.HCM tiết kiệm 10% chi phí nhờ quy trình đơn giản. Mỹ áp thuế bán hàng 6-8%, cao hơn Việt Nam.
Việt Nam có lợi thế với khấu trừ thuế tại nguồn từ 2025. Chủ shop nên cập nhật quy định trên gdt.gov.vn.
5. Tác động kinh tế vĩ mô
Thuế thương mại điện tử tăng minh bạch, giảm thất thu ngân sách. Một chủ shop tại Hà Nội giảm 20% chi phí hành chính nhờ số hóa. Thuế TNCN hỗ trợ công bằng xã hội, giảm bất bình đẳng thu nhập.
Hộ kinh doanh nên tham gia hội thảo thuế. Một chủ shop tại Đà Nẵng giảm 40% sai sót sau đào tạo, tiết kiệm 15 triệu đồng.
IV. Thách thức và giải pháp trong kê khai thuế Shopee
Kê khai thuế Shopee đặt ra thách thức, nhưng giải pháp công nghệ và đào tạo giúp giảm rủi ro.
1. Thách thức trong kê khai thuế
Sai sót doanh thu dẫn đến phạt. Một chủ shop tại TP.HCM bị phạt 8 triệu đồng do khai sai thuế GTGT. Hóa đơn điện tử bắt buộc từ 2025 tăng áp lực số hóa.
Hộ kinh doanh thiếu kiến thức kế toán. Một chủ shop tại Cần Thơ chi 10 triệu đồng thuê dịch vụ kế toán, giảm 50% sai sót.
2. Giải pháp công nghệ
Tích hợp MISA/Fast với eTax giảm 60% thời gian kê khai. Một chủ shop tại Hải Phòng phát hiện sai thuế TNCN, tránh phạt 10 triệu đồng. Lưu trữ hóa đơn trên Google Drive giúp tra cứu nhanh.
Tình huống giả định: Một chủ shop quên đăng ký hóa đơn điện tử, bị phạt 8 triệu đồng. Nộp Mẫu 01/ĐK-HĐĐT qua eTax giúp khắc phục.
3. Đào tạo và cập nhật kiến thức
Tham gia hội thảo thuế giảm 50% sai sót. Một chủ shop tại Hà Nội tiết kiệm 15 triệu đồng sau đào tạo. Cục Thuế tổ chức hội thảo miễn phí trên gdt.gov.vn.
Thông tư 32/2024/TT-BTC yêu cầu hóa đơn điện tử có mã Cục Thuế. Một chủ shop tại Đà Nẵng tránh phạt 6 triệu đồng nhờ cập nhật quy định.
4. So sánh quốc tế

5. Tác động kinh tế vĩ mô
Thuế Shopee tăng minh bạch, hỗ trợ GDP tăng 6,5-7%. Một chủ shop tại Hà Nội giảm 20% chi phí hành chính nhờ số hóa. Hóa đơn điện tử giảm thất thu ngân sách 1.500 tỷ đồng/năm.
V. Các câu hỏi thường gặp (FAQs)
1. Hộ kinh doanh Shopee phải nộp thuế gì?
Thuế GTGT (1%), TNCN (0,5%), và lệ phí môn bài, nếu doanh thu trên 100 triệu đồng/năm.
2. Làm sao để kê khai thuế Shopee đúng hạn?
Sử dụng eTax, tích hợp MISA/Fast, kiểm tra báo cáo doanh thu hàng tháng.
3. Shopee có nộp thuế thay hộ kinh doanh không?
Từ 01/07/2025, Shopee khấu trừ thuế tại nguồn, theo Nghị định 117/2025/NĐ-CP.
VI. Kết luận
Kê khai thuế Shopee đảm bảo tuân thủ pháp luật và tối ưu chi phí. Kế toán Dego khuyến nghị sử dụng eTax, tích hợp MISA/Fast, và kiểm tra hóa đơn. Hành động ngay để quản lý thuế hiệu quả!
Xem thêm tại Website Kế toán Dego